Morphonet: la rivoluzione del bioimaging
Di Giovanni Sapere
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Morphonet rientra negli studi di ricerca sulla biomorfologia – lo studio delle forme e delle strutture degli organismi biologici – che sono in crescita grazie agli enormi progressi tecnologici.
Lo studio
I progressi nel campo dell’imaging hanno portato a un aumento delle conoscenze e delle competenze nella ricerca morfologica. Un team di ricercatori dell’Università di Montpellier, in collaborazione con Lione e Tolosa, ha lanciato MorphoNet.org, un browser morfodinamico che funziona con Firefox, aperto al pubblico per condividere le conoscenze nel campo della ricerca. Attraverso il portale è possibile eseguire diversi studi trasversali sul genotipo e sul fenotipo degli organismi. Rispetto alle piattaforme di visualizzazione morfologica, MorphoNet ha un potenziale per un utilizzo su larga scala.
fonte: Schermata della dimostrazione di MorphoNet di una testa umana. Credit: Leggio et al. Pubblicato su Nature Communications
Come funziona
MorphoNet offre due tipi di accesso: gli utenti non registrati possono accedere ai set di dati pubblici e possono solo visualizzare i dati, mentre gli utenti registrati hanno diritti aggiuntivi, come la possibilità di caricare e scaricare dati.
La principale sfida nella creazione di un browser morfologico è stata la compressione dei Big Data. Per superarla sono state impiegate sofisticate tecniche informatiche che utilizzano i linguaggi Python e ImageJ.
I ricercatori sperano che Morphonet venga utilizzato in modo sempre più costante dalla comunità scientifica.
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