Morphonet : la révolution de la bio-imagerie

Morphonet s’inscrit dans les études de recherche sur la biomorphologie – l’étude des formes et des structures des organismes biologiques – qui se développent grâce aux énormes progrès technologiques.

L’étude

Les progrès dans le domaine de l’imagerie ont entraîné un accroissement des connaissances et des compétences dans la recherche en morphologie. Une équipe de chercheurs de l’Université de Montpellier, en collaboration avec Lyon et Toulouse, a lancé MorphoNet.org, un navigateur morphodynamique qui fonctionne avec Firefox, ouvert au public pour partager les connaissances dans le domaine de la recherche. Grâce au portail, il est possible de réaliser diverses études transversales sur le génotype et le phénotype des organismes. Par rapport aux plateformes de visualisation morphologique, MorphoNet présente un potentiel d’utilisation à grande échelle.

source : Capture d’écran de la démonstration de MorphoNet sur une tête humaine. Crédit : Leggio et al. Publié dans Nature Communications

Comment ça marche

MorphoNet propose deux types d’accès : les utilisateurs non inscrits peuvent accéder aux jeux de données publics et ne peuvent que consulter les données, tandis que les utilisateurs inscrits disposent de droits supplémentaires, comme la possibilité de téléverser et de télécharger des données.

Le principal défi dans la création d’un navigateur morphologique a été la compression des Big Data. Pour le surmonter, des techniques informatiques sophistiquées ont été utilisées, avec les langages Python et ImageJ.

Les chercheurs espèrent que Morphonet sera utilisé de façon de plus en plus constante par la communauté scientifique.

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